De plot van Jurassic World 2, aan de andere kant, is grotendeels onduidelijk. Schrijver Colin Trevorrow zei echter eerder dat het verhaal van het vervolg dierenmishandeling met betrekking tot de dinosauriërs zal aanpakken, wat grotendeels onbekend terrein is voor de franchise. Een recent rapport over de productie geeft aan dat dierenrechten net zo belangrijk zullen zijn voor het perceel als Trevorrow het deed klinken.
Zoals gerapporteerd door Jurassic Outpost, heeft NBCUniversal op 15 december 2016 drie nieuwe webdomeinen gekocht. Alle drie de domeinen bieden subtiele hints naar het uitgangspunt van Jurassic World 2 met alleen hun namen: AllCreaturesHaveRights.com (en.org) en IslaNublarRescueMission.com. De eerste verwijst sterk naar de aanwezigheid van een of andere vorm van "dinosaurusrechten" -groep als onderdeel van de film, terwijl de laatste een verwijzing is naar Isla Nublar, de thuisbasis van de themaparken die zowel in Jurassic World als in het originele Jurassic Park zijn afgebeeld.
Chris Pugh van Jurassic Outpost tweette vrijdag dat "Isla Nublar Rescue Mission" zou kunnen verwijzen naar de officiële titel van Jurassic World 2, verwijzend naar de "veelzeggende zet" van Universal toen het de domeinnaam voor "Fate of the Furious" kocht. Toch vindt Pugh het "onwaarschijnlijk" dat het domein de titel van Jurassic World 2 is. Het meest waarschijnlijke scenario is dat de "Reddingsmissie" verwijst naar een plotapparaat, zoals een fictieve organisatie … of letterlijk gewoon een echte missie.
Jurassic Outpost theoretiseerde dat de plot van Jurassic World 2 zal draaien rond de vernietiging van het park en de dinosaurussen die er wonen, en de daaropvolgende juridische en ethische strijd die plaatsvindt. Het rapport speculeert dat "Isla Nublar Rescue Mission" verwijst naar een missie om dinosauriërs te redden, in plaats van mensen. Wat de plot ook blijkt te zijn, Jurassic World 2 zal waarschijnlijk complexe thema's onderzoeken die verband houden met de dinosauriërs en de mensen die ze hebben gemaakt, in plaats van een meer monsterfilmbenadering te volgen die lijkt op minder gedenkwaardige Jurassic Park-sequels. Het is een intrigerend uitgangspunt en een verfrissende manier om een film over in gevangenschap levende dinosauriërs te benaderen.
Het uitgangspunt van Jurassic World 2 heeft naar verluidt Bryce Dallas Howard verrast, wat betekent dat er weinig kans is dat het vervolg weer een doorsnee dodelijke dinosaurusfilm zal zijn. Bayona noemde het vervolg eerder een 'leuk' dinosaurusavontuur, maar hintte ook naar politieke elementen die een grote rol spelen in de film. De domeinnamen maken duidelijk dat Jurassic World 2 politieke thema's zal bevatten, maar het zal pas duidelijk zijn wat voor soort film het wil worden als er meer nieuwe informatie uitkomt.